小儿甲亢的治疗不同于成人，在口服药、手术及核素碘-131治疗三者中，首选为口服药，一般单疗程为2～3年，但复发率高。药物选择应根据患儿年龄、病程、甲亢类型、甲状腺大小以及药物反应、有无桥本病、家长能否坚持指导用药等而定，仅在药物治疗无效时才考虑手术或核素碘-131治疗。
(一)一般治疗：
注意休息及剧烈运动，在读学生免修体育课，应选富有蛋白质、糖类及维生素等营养丰富的食品。
(二)药物治疗
1.甲巯咪唑(他巴唑)：可按每天0.4～0.6mg/kg，分2或3次口服，用药1～3个月后病情基本得到控制，减量方法与成人甲亢类似。副作用中严重者可发生粒细胞减少、肝损害、肾小球肾炎、脉管炎等，虽属罕见，在使用中仍须仔细观察，及时发现与对症处理。
2.丙硫氧嘧啶(PTU)：除抑制甲状腺激素的合成外，同时还减少在外周组织的T4转化成T3，毒性与甲巯咪唑类相同，初始剂量为每天4～6mg/kg，因其半衰期较甲巯咪唑(他巴唑)短，故需分3次服用。
3.普萘洛尔：如心血管症状明显者可加用肾上腺素能受体阻断药普萘洛尔(心得安)作为辅助药物，减轻交感神经过度兴奋所致的心率快、多汗及震颤等症状，用量为每天1～2mg/kg，分3次口服，症状缓解逐渐减量与停药。
4.甲状腺制剂：治疗过程中若出现甲低，甲状腺肿大或者突眼更明显者，应加服甲状腺素(优甲乐)12.5～25ug/d，并酌情减少甲巯咪唑(他巴唑)用量。
(三)手术治疗：
对有药物过敏、粒细胞减少或甲状腺明显肿大或服药后甲状腺缩小不明显或服药后复发者，可考虑甲状腺手术治疗。术前应用抗甲状腺药物2～3个月使甲状腺功能正常，术前服碘/碘化钾(复方碘溶液)1～2周，自术前4天至术后7天，口服普萘洛尔(心得安)1～2mg/kg，每6小时1次，手术后甲低发生率为50%，少数出现暂时性或永久性甲状旁腺功能减低。
(四)核素碘-131治疗：
近来不少学者推荐小儿甲亢在药物治疗复发或甲状腺明显肿大时可考虑或首选碘-131治疗，具有简单、有效、经济且治愈率高的优点，治疗后甲状腺可明显缩小，尽管远期甲低发生率较高，但通过甲状腺素替代治疗可获得满意的生长发育及生活质量。
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